O trabalho mostra o envolvimento do SNC em 42 casos de micoses oportunistas em material de autópsia, sendo enfatizada a baixa freqüência do comprometimento encefálico, o que apareceu na proporção aproximada de 1/400 casos de autópsia. A criptococose apareceu como a micose mais freqüente no envolvimento do SNC sendo encontrada em 8 dos 9 casos estudados, seguido pela aspergilose que comprometeu o encéfalo em 2 dos 5 casos estudados. Apesar do grande número de casos de candidiase examinados não hauve lesão encefálica por esta micose. O estudo das alterações histológicas observadas nos casos de criptococos mostrou aspectos diferentes daqueles classicamente descritos nesta micose, com referência particular à existência de grande reação inflamatória com formação de células gigantes em grande número e, mais ainda, com referência ao envolvimento do plexo coróide observado em 2 casos. O trabalho chama atenção para a possibilidade da caracterização morfológica dos fungos nos tecidos, mostrando a importncia do papel desempenhado pelo histopatologista no diagnóstico de micoses no material de autpsia, particularmente nos casos em que os fungos representam achado incidental no estudo de rotina.