A eletroforese de campo pulsado foi usada para separar cromossomos de quatro isolados de Metarhizium anisopliae procedentes do Brasil. Isolados de M. anisopliae procedentes do Japão foram descritos como possuindo sete cromossomos. Variações em relação aos isolados brasileiros foram observadas, tendo sido claramente detectadas oito bandas no isolado CG46. A análise densitométrica da intensidade dos cromossomos sugere que, sob as condições utilizadas, os outros isolados brasileiros também apresentam oito cromossomos, com dois cromossomos migrando conjuntamente, como duplos. O tamanho do genoma foi estimado como variando entre 23.39 e 31.88 Mb, não incluindo os cromossomos possivelmente resolvidos como duplos.
