Amostras de populações naturais de Anopheles darlingi foram analisadas para 19 locos, dos quais 12 apresentaram variação, com uma proporção de locos polimórficos de 68,40%. A população de Ariquemes mostrou maior variabilidade, com maior número de alelos por loco (2,26 ± 0,08) e maior polimorfismo (P = 63,15). Levando-se em conta os níveis de heterozigosidade intraloco observados e esperados, os maiores valores foram observados na população de Manaus (Ho = 0,432 ± 0,11; He = 0,375 ± 0,08) e os menores na população de Cachoeira Porteira (Ho = 0,236 ± 0,09; He = 0,290 ± 0,11). Quando analisados pelas estatísticas F de Wright, os resultados mostraram desequilíbrio decorrente de excesso de homozigotos, conforme mostram os valores de Fis > Fst (0,083 > 0,026), denotando uma certa diferenciação intrapopulacional. As quatro populações estudadas foram semelhantes geneticamente, conforme indicam os valores de distância e similaridade. As variações cromossômicas de populações da Amazônia não indicaram diferenciação geográfica, e na região central da bacia amazônica, estas foram altamente polimórficas em relação às marginais, que foram predominantemente monomórficas.
