O presente trabalho foi desenvolvido visando determinar a aplicabilidade da análise de RAPD na identificação de indivíduos pertencentes a duas sub-espécies de cascavéis sul-americanas (Crotalus durissus terrificus e Crotalus durissus collilineatus). As 11 sequências arbitrárias inicializadoras testadas nestes experimentos, amplificaram um total de 161 bandas, das quais 31% foram polimórficas na comparação entre espécimes de Cratalus. Os resultados combinados obtidos com as distintas sequências inicializadoras, permitiram a identificação de todos os indivíduos avaliados. Várias bandas características de cada sub-espécie foram identificadas. O dendrogama, baseado em marcaodres de RAPD, mostra tres grupos que correspondem às duas sub-espécies de Crotalus e ao especimen de Bothrops jararaca.
