Nesta revisão são analisados os dados citogenéticos disponíveis na literatura relativos à ictiofauna da bacia do Rio Iguaçu, a qual é caracterizada pelo alto grau de endemismo e pela baixa diversidade de espécies. Das oitenta e uma espécies conhecidas, vinte e quatro já foram cariotipadas sendo 6 Characiformes, 14 Siluriformes e 4 Perciformes. Os dados cromossômicos evidenciam a complexidade taxonômica e sistemática dos grupos. São propostas hipóteses relacionadas à evolução de alguns grupos de Characiformes e Siluriformes do Rio Iguaçu, assim como o aproveitamento de dados cariotípicos para a citotaxonomia.
