Esse trabalho teve como objetivo identificar e avaliar as variações espaciais e sazonais das apendiculárias no estuário do rio Caravelas e área costeira adjacente (17º35' - 18º22' S e 39º8' - 39º55'W). As coletas foram realizadas em 12 campanhas durante cinco anos (2001 e 2003 - 2006). Foram identificadas dez espécies, sendo que Oikopleura dioica, O. rufescens e O. longicauda foram as mais abundantes. Estas três espécies representaram mais de 95% do total de apendiculárias coletadas. As outras espécies foram menos freqüentes e ocorreram em baixas densidades. A densidade média de apendiculárias encontrada nas estações e costeiras (804 ind.m-3) foi maior que na de estuário (158 ind.m-3). As diferenças encontradas entre as estações de estuário e costeiras não foram significativas (p=0,73). As campanhas realizadas durante o período seco apresentaram densidade média (587 ind.m-3) maior que do período chuvoso (376 ind.m-3). As diferenças entre os períodos chuvoso e seco foram estatisticamente significativas (p>0,01).