Consideráveis evidências indicam que mecanismos serotoninérgicos, particularmente o transportador de serotonina, estão envolvidos no alcoolismo e no uso de fumo e são influenciados pelo polimorfismo da região promotora do 5HTT (5-HTTLPR). Como o consumo de álcool e fumo está implicado na patogênese do câncer, o objetivo deste estudo foi investigar o polimorfismo 5-HTTLPR em pacientes com carcinoma bucal de células escamosas (CBCE) comparado com um grupo controle em uma amostra de pacientes brasileiros. Cento e três pacientes afetados por CBCE e 103 voluntários sem história de CBCE foram genotipados para 5-HTTLPR. Ambos os grupos foram pareados pela idade, gênero e uso de fumo. O teste do qui-quadrado foi usado para análise estatística. Não houve diferença estatística entre os genótipos dos grupos caso e controle (p= 0,408). Concluindo, a presente investigação demonstrou que os polimorfismos do transportador de serotonina não estão implicados no desenvolvimento do CBCE.