O objetivo desse artigo foi avaliar a expressão das citocinas induzidas por MTA após a perfuração experimental de furca, em camundongos. Camundongos Balb/c (n=5) foram submetidos à perfuração induzida da furca do primeiro molar superior, seguido pelo selamento da mesma com MTA no lado esquerdo (grupo experimental) e com parafina no lado direito (grupo controle). Os animais foram sacrificados 7, 14 e 21 dias após o tratamento da perfuração. A expressão gênica dos níveis de IFN-γ, TNF- α, IL-10, IL-4, TGF- β e RANKL foram investigadas por PCR em tempo real nos dentes e tecidos adjacentes. No grupo experimental, após 7 dias, houve uma diminuição da expressão dos níveis de TNF- α e IL-4 comparados ao 14° dia (p<0,05). Nesses mesmos grupos, os níveis de mRNA de RANKL, IFN- γ e TNF- α foram estatisticamente maiores após 14 dias comparados a 21 dias após o tratamento com MTA (p<0,05). Os níveis de IL-10 estavam aumentados no 21o dia (p<0,05). A expressão de mRNA do TGF- β não apresentou alteração estatisticamente relevante. Houve uma redução estatística da expressão gênica da IL-4 quando os grupos controle e experimental foram comparados nos dias 7 e 21. Em conclusão, o selamento com MTA favoreceu a expressão de citocinas pró-inflamatórias na fase intermediária da resposta imuno-inflamatória (14o dia). A redução dessas citocinas, na fase tardia da resposta, ocorreu provavelmente devido à imunoregulação da expressão de IL-10.