GenoSSRFinder: uma ferramenta para detecção de repetição de sequência simples rápida, precisa e direcionada em estudos genômicos

Resumo

O GenoSSRFinder é uma nova ferramenta que possibilita a pesquisa de Simple Sequence Repeats (SSRs) em sequências de DNA e genomas muito mais simples e precisos em curto espaço de tempo. A análise é realizada visando um determinado SSR no genoma e nas sequências de genes. Este utilitário é rápido, preciso e faz sua função muito bem. Ele percorre rapidamente a sequência, revelando todos os locais em que o SSR selecionado pode ser encontrado. Essa ferramenta informará aos pesquisadores onde o SSR selecionado começa e onde termina, quanto tempo dura, com que frequência se repete e quanto tempo dura cada repetição. O GenoSSRFinder obtém as descobertas rapidamente e elas serão simples de compreender. Portanto, ao estudar SSRs, os pesquisadores terão mais tempo para usar em trabalhos minuciosos como resultado dessa economia de tempo. Além disso, fornece uma informação valiosa, pois é altamente precisa. O GenoSSRFinder é simples de usar e produz achados de alta qualidade. Também está acelerando a pesquisa de genes SSRs, que é um resultado direto da nova abordagem que usamos para analisar SSRs. Três estudos de caso neste estudo demonstraram a utilidade deste programa ao estudar imediatamente um SSR específico que foi associado a doenças genéticas, biodiversidade e ciência criminal em organismos vivos. Esta demonstração explica que o GenoSSRFinder pode ser utilizado em uma ampla variedade de campos, como a pesquisa de doenças genéticas, a biodiversidade e estudos genéticos, ou mesmo em investigações criminais.

Palavras-chave:
GenoSSRFinder; SSRs; repetições de sequência simples