Identificação dos principais genes envolvidos no carcinoma nasofaríngeo☆

GSE12452 foi obtido da base de dados Gene Expression Omnibus e inclui 31 amostras de carcinoma nasofaríngeo e 10 amostras de tecido nasofaríngeo normal. Os genes diferencialmente expressos foram analisados por ANOVA no kit PGS. Usando o plugin BiNGO no Cytoscape e análise de enriquecimento da via no kit PGS, análises de enriquecimento funcional e da via foram realizadas separadamente para prever as potenciais funções dos genes diferencialmente expressos. Além disso, os pares Fator de Transcrição - genes diferencialmente expressos foram pesquisados e em seguida a sua rede reguladora foi visualizada usando o programa Cytoscape.

Resultados:

Um total de 487 genes foram analisados como genes diferencialmente expressos entre as amostras de carcinoma nasofaríngeo e amostras de tecido nasofaríngeo normal. A análise de enriquecimento indicou que PTGS2 estava envolvido na regulação do processo biológico e câncer pulmonar de pequenas células. ZIC2 e OVOL1 podem funcionar no carcinoma nasofaríngeo almejando-se de maneira significativa os genes suprarregulados (como o PTGS2, FN1, CXCL9 e CXCL10) na rede reguladora de fator de transcrição - genes diferencialmente expressos (p.ex., ZIC2→PTGS2 e OVOL1→CXCL10).

Conclusão:

PTGS2, FN1, CXCL9, CXCL10, ZIC2 e OVOL1 podem desempenhar alguns papéis no carcinoma de nasofaringe.

Palavras-chave:
Carcinoma nasofaríngeo; Genes diferencialmente expressos; Análise de enriquecimento; Rede reguladora

Termo	Descrição	Número do gene	Símbolo do gene	Valor p
A
30198	Organização da matriz extracelular	9	COL18A1, COL4A2……	6,73E-08
30199	Organização colágeno fibrila	5	COL3A1, COL1A2……	1,44E-06
43062	Organização da estrutura extracelular	9	COL3A1, COL1A2……	2,85E-06
50789	Regulação do processo biológico	72	PTGS2, EZH2……	3,35E-06
32964	Processo biossintético de colágeno	3	COL1A1, COL5A1, COL5A1	3,91E-06
43588	Desenvolvimento da pele	5	COL5A2, COL5A1……	4,77E-06
65007	Regulação biológica	74	SLC9A7, PTGS2……	6,95E-06
6950	Resposta ao estresse	30	C3AR1, PTGS2……	8,65E-06
9611	Resposta à formação de feridas	15	BMP2, TNFSF4……	1,03E-05
6954	Resposta inflamatória	11	CXCL9, PLA2G7……	2,15E-05

B
10880	Regulação da liberação de íon de cálcio sequestrado em citosol pelo retículo sarcoplasmático	4	CALM3, FKBP1B……	2,32E-07
30855	Diferenciação de células epiteliais	13	EREG, ELF3……	1,30E-06
60316	Regulação positiva da atividade do canal de liberação de cálcio sensível a rianodina	3	CALM2, CALM1, CALM1	3,21E-06
60314	Regulação atividade do canal de liberação de cálcio sensível a rianodina	4	FKBP1B, CALM2……	9,20E-06
60315	Regulação negativa de atividade do canal de liberação de cálcio sensível a rianodina	3	CALM3, CALM2, CALM1	1,27E-05
7017	Processo baseado no microtúbulo	14	TPPP3, DNAH9……	1,92E-05
8544	Desenvolvimento da epiderme	12	CST6, EREG……	2,15E-05
1539	Motilidade ciliar ou flagelar	4	TEKT2, DNAH2……	3,02E-05
7018	Movimento baseado no microtúbulo	9	DNAH2, DNAH7……	3,72E-05
30216	Diferenciação de ceratinócito	7	PPL, CNFN……	3,90E-05
C
Interação ECM-receptor		11	COL1A1, COL1A2……	9,01E-10
Digestão e absorção da proteína		10	COL1A2, COL3A1……	9,05E-09
Amebíase		10	CD14, COL1A2……	1,25E-07
Câncer de pulmão de pequenas células		8	PTGS2, FN1……	3,10E-06
Infecção por Staphylococcus aureus		5	C3AR1, FCGR2A……	2,66E-04
Diferenciação de osteoclastos		6	SOCS1, TYK2……	2,23E-03
Via de sinalização do receptor Toll-like		5	CXCL9, NFKBIA……	4,54E-03
Reprodução do DNA		3	PCNA, MCM2……	6,36E-03
Leishmaniose		4	FCGR2A, PTGS2……	6,94E-03
Ciclo celular		5	CCNE2, SMC1A……	9,53E-03

D
Metabolismo do fármaco-citocromo P450		9	ADH1 C, ADH7……	3,02E-07
Metabolismo de xenobióticos por citocromo P450		8	ADH7, ALDH1A3……	8,48E-06
Metabolismo da tirosina		5	ALDH3A1, ALDH3B2……	1,69E-04
Glicólise/gliconeogênese		6	ADH7, ALDH1A3……	2,51E-04
Metabolismo da histidina		4	ALDH3A1, ALDH3A2……	5,74E-04
Metabolismo de beta-alanina		4	ALDH3A2, ALDH3B2……	6,59E-04
Metabolismo de fenilalanina		3	ALDH1A3, ALDH3A1, ALDH3B2	1,88E-03
Junção de oclusão		7	CGN, CLDN7……	2,40E-03
Fototransdução		3	CALM1, CALM2, CALM3	7,52E-03
Metabolismo do retinol		4	DHRS9, SDR16C5……	1,03E-02

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[1] * Autor para correspondência. E-mail:13933985866@163.com (W. Lu).

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Identificação dos principais genes envolvidos no carcinoma nasofaríngeo☆ ☆ Como citar este artigo: Jiang X, Feng L, Dai B, Li L, Lu W. Identification of key genes involved in nasopharyngeal carcinoma. Braz J Otorhinolaryngol. 2017;83:670-6.

Resumo

Introdução:

Objetivo:

Método:

Resultados:

Conclusão:

Identificação dos principais genes envolvidos no carcinoma nasofaríngeo^☆ ☆ Como citar este artigo: Jiang X, Feng L, Dai B, Li L, Lu W. Identification of key genes involved in nasopharyngeal carcinoma. Braz J Otorhinolaryngol. 2017;83:670-6.