Membros do gênero Begomovirus, família Geminiviridae, estão entre os vírus mais importantes que infetam plantas nas regiões tropicais e subtropicais do mundo. Nas Américas, begomovirus vêm causando danos significativos especialmente para a produção de tomates (Lycopersicon esculentum). Inúmeros novos vírus têm sido relatados na região, e ao menos um, o Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), foi introduzido do Velho Continente através de plântulas infetadas. Além disso, recombinação aparentemente é um fator importante contribuindo para uma maior diversidade desses vírus, dificultando seu controle. Esta situação levou à procura de medidas de controle que vão além das normalmente utilizadas como resistência genética, controle químico e cultural. Nesta revisão, além de medidas tradicionais de controle de begomovirus, são discutidas principalmente estratégias de controle alternativas, como a utilização de plantas transgênicas, assim como os mecanismos envolvidos em tais estratégias