A cadeia primária da molécula de RNAr 5S exibe variações na sua seqüência nucleotídica. Tais variações são devidas quase que exclusivamente a fixação de mutações pontuais (transversão e transição). Conseqüentemente, o tamanho da molécula tem permanecido constante e dependências entre as bases são previsíveis. Visando caracterizar a natureza e determinar o grau dessas dependências, procedemos a uma análise de correlação seguida por uma análise fatorial por componente principal da amostragem disponível no Berlin RNA Data Bank. Os resultados demonstram que o conteúdo das purinas e das pirimidinas tende a permanecer constante, de tal forma que A + G = Kpur e C + U = Kpir. Nesses termos, a composição das quatro bases dada agora pela razão Kpur/Kpyr é também igual a uma constante (Ks). O índice Ks implica que o comportamento das mutações nos sítios variáveis da molécula segue regras impostas pela natureza química das bases envolvidas, explicando assim porque as mutações do tipo transição são mais favorecidas na molécula em relação às transversões e às inserções-deleções (raras no 5S), visto que as primeiras não alteram o Ks.
