Uma análise do perfil dos antígenos HLA de classe II numa amostra da população de São Paulo é descrita neste trabalho. Os dados foram obtidos através de técnicas de amplificação gênica utilizando-se iniciadores seqüências-específicos para HLA-DRB (PCR-SSP) ou amplificação gênica seguida de hibridação com oligonucleotídeos específicos (PCR-SSOP) para HLA-DQA e DQB. Foram calculadas as freqüências gênicas e as freqüências haplotípicas DRB-DQB e DQA-DQB e a população mostrou estar em equilíbrio genético de acordo com a lei de Hardy-Weinberg. Finalmente, comparamos também os dados obtidos com os da população de Porto Velho, Rondônia, salientando a importância da obtenção de dados regionais para os controles quando se estuda este complexo sistema genético.