Os experimentos de intercruzamento de cepas constituem um valioso meio de mapear genes que afetam caracteres quantitativos complexos. Nós estudamos a variabilidade genética do intercruzamento das cepas procriadas por endogamia de camundongos Large (LG/J) e Small (SM/J), como um guia para estudos de mapeamento gênico. Dez machos SM/J foram cruzados com 10 fêmeas LG/J, após o que os animais foram acasalados aleatoriamente para produzir as gerações intercruzadas F1, F2 e F3. Os 1632 animais da geração F3 das 200 famílias de irmãos completos foram usados para calcular a herdabilidade e as correlações genéticas dos caracteres medidos. Um subgrupo de famílias foi submetido a adoção cruzada após o nascimento, para permitir a avaliação da importância dos efeitos maternos pós-natais. Foram coletados dados semanais de peso corporal da 1ª à 10ª semanas, assim como dados de necropsia do peso corporal, peso de órgãos, peso do coxim gorduroso reprodutor e comprimento de cauda nas gerações intercruzadas. Não houve heterose para pesos específicos para idade ou caracteres de necropsia, exceto pelo fato de que o peso da 1ª semana foi o maior na geração F2, indicando heterose dos efeitos maternos nas mães da geração F1. Encontramos herdabilidade moderada/alta para a maioria dos pesos específicos para a idade e dos caracteres de necropsia. Os efeitos maternos foram significantes para os pesos específicos para a idade da 1ª à 4ª semana, mas desapareceram completamente para o peso de 10 semanas. Os efeitos maternos para os caracteres de necropsia foram pequenos e não estatisticamente significantes. Os pesos específicos para a idade mostraram um padrão de correlação típico, com declínio da correlação à medida que a diferença em idades aumentava. Entre os caracteres de necropsia, os pesos corporal e do coxim gorduroso reprodutor mostraram alta correlação genética. A maioria das outras correlações genéticas foram pequenas ou moderadas. O intercruzamento entre cepas procriadas por endogamia de camundongos SM/J e LG/J constituem fonte valiosa para o mapeamento de loci de caracteres quantitativos para o tamanho corporal e sua composição e morfologia.