Os marcadores fenotípicos cor da pelagem, padrão e comprimento dos pelos de populações naturais de gato doméstico de quatro cidades (Barcelona, Catalunha; Palma Majorca, Ilhas Baleares; Rimini, Itália, e Buenos Aires, Argentina) foram estudados em nível microgeográfico. Várias técnicas de genética de populações revelaram que o grau de diferenciação genética entre populações de Felis catus nessas cidades é relativamente baixo, quando comparado com aquele encontrado entre populações de outros mamíferos. Dois diferentes níveis de amostragem foram usados. Um foi o de colônias "naturais" de famílias de gatos vivendo juntas em pontos específicos das cidades e o outro foi de subpopulações "artificiais", ou grupos de colônias, habitando o mesmo bairro de uma cidade. Para os dois níveis de amostragem, alguns dos resultados foram idênticos: 1) pouca heterogeneidade gênica, 2) existência de panmixia, 3) níveis semelhantes de heterozigosidade esperada em todas as populações analisadas, 4) ausência de autocorrelação espacial, com certa diferenciação na população de Buenos Aires comparada às outras, e 5) correlações muito altas entre colônias e subpopulações com os primeiros fatores de uma análise de fator Q. Não obstante, outros dados estatísticos de genética de população mostraram-se muito afetados pela escolha diferencial do nível de amostragem. Foi o caso de: 1) a quantidade de heterogeneidade dos dados estatísticos FST e GST entre as cidades, que foi maior no nível de subpopulação do que no nível de colônia; 2) a existência de correlações entre os dados estatísticos de diferenciação gênica e variáveis de tamanho no nível subpopulacional, mas não no nível de colônias, e 3) a relação entre as variáveis genéticas e os principais fatores da análise fatorial R. Isto sugere que se deve tomar cuidado ao escolher a unidade de amostragem, para que as inferências a respeito da genética de população sejam válidas a nível microgeográfico.
