Um procedimento para determinação de selênio em águas, completamente mecanizado, foi desenvolvido empregando um fotômetro baseado em LED e mini-bombas solenóide como dispositivos de propulsão. O método proposto é baseado na reação de selênio com iodeto de potássio em meio ácido para liberar iodo, o qual oxida a variamina azul formando um composto violeta que absorve em 530 nm. O sistema foi mecanizado empregando o processo de multicomutação em fluxo e uma estratégia de parada de fluxo na etapa final para desenvolvimento da reação. A curva analítica foi linear entre as concentrações de 0,010 a 0,500 mg L-1, segundo a equação ΔA = 0,501 (± 0,004) C (R = 0,999). O limite de detecção (3σ/S) obtido com o método proposto foi de 0,004 mg L-1. Desvios padrão relativo de 1,6 e 1,8% (n = 4) foram obtidos para soluções de Se com concentrações de 0,050 e 0,200 mg L-1, respectivamente. A freqüência de amostragem foi de 23 determinações por hora, e a exatidão foi de 95% de probabilidade.