Este estudo teve como principal objetivo determinar a capacidade de complexação da Matéria Orgânica (MO) de regiões tipicamente agrícolas e urbanas, com os íons de cobre e níquel. As amostras foram coletadas durante as estações de seca e chuva e submetidas ao estudo da capacidade de complexação e da constante de estabilidade condicional da MO com os íons Cu(II) e Ni(II) usando um Espectrofluorímetro de Luminescência e o Sistema de Ultrafiltração de Fluxo Tangencial. Os valores da constante de estabilidade condicional (log Kc) da MO com o íon cobre variaram de 0,04 a 1,35 sendo o maior valor obtido para o local com maior carbono orgânico dissolvido (COD 2,73-2,43 mg L-1) e o menor para local de menor COD, corroborando com o grau de aromaticidade. Conclui que a Matéria Orgânica Dissolvida (MOD) de rios de áreas agrícolas e urbanas continha um número menor de sítios de ligação, quando comparado com outros locais.