O planejamento de coleções combinatórias de compostos constitui, atualmente, um dos principais paradigmas da química medicinal. Muitos dos procedimentos publicados na literatura são "ótimos" por satisfazerem certos objetivos previamente definidos. Suas eficiências podem ser comparadas, mas em geral, torna-se muito difícil a comparação com coleções geradas por métodos diferentes ou mesmo por métodos que utilizem parametrizações diferentes. Isto é particularmente verdadeiro quando parâmetros outros que não os de diversidade molecular são importantes. Este artigo discute várias maneiras de comparar coleções de compostos, visual e numericamente.
