Os sistemas estuarinos desempenham um importante papel na retenção de elementos traços devido à afinidade destes com algumas partículas dissolvidas em água. Nesse trabalho, apresenta-se o uso de um sensor voltamétrico para monitorar as concentrações de Zn (II), Cd(II) e Pb (II) na região do Sistema Estuarino Lagunar de Cananéia-Iguape (estado de São Paulo). No setor sul, (Cananéia) obteve-se menores valores de concentração, e no setor norte (Iguape) os valores foram maiores devido às atividades antrópicas, com ênfase à introdução prévia de resíduos de mineração e insumos de efluentes agrícolas, industriais e domésticos. O método proposto é viável, barato e rápido, e permite a determinação dos íons metálicos simultaneamente. Além disso, o dispositivo portátil é simples e pode ser facilmente utilizado para medições de campo a bordo de navios oceanográficos.