Este trabalho descreve um método para quantificação dos alcaloides harmana e harmina na polpa e nas sementes dos frutos de maracujá azedo (Passiflora edulis f. flavicarpa O. Degener, Passifloraceae), por extração dual por sorção com barra magnética e cromatografia líquida de alta eficiência com detecção por fluorescência (SBSE-LC/Flu dual). Os parâmetros para SBSE foram otimizados usando planejamento fatorial e o método dual SBSE-LC/Flu foi validado seguindo os parâmetros do International Conference on Harmonisation of Technical Requirements for Registration of Pharmaceuticals for Human Use (ICH). A grande sensibilidade e o pequeno manuseio da amostra tornam o método SBSE-LC/Flu dual atraente para aplicação em análise fitoquímica ou de alimentos.