Investigou-se a incidência de desoxinivalenol (DON), nivalenol (NIN), diacetoxiscirpenol (DAS) e toxinas T-2 (T2) e HT-2 (HT2) em 80 amostras de milho do estado de São Paulo/ Brasil, coletadas nos silos de duas cooperativas deste estado. As amostras foram extraídas com água/acetonitrila e purificadas com colunas Mycosep. Após derivatização com anidrido trifluoroacético as amostras foram analisadas por cromatografia gasosa-espectrometria de massas. Os limites de detecção ficaram entre 10 ng g-1 e 40 ng g-1. NIV foi encontrada em 5 amostras e DON e NIV ocorreram simultaneamente numa das amostras. DAS, T2 e HT2 não foram detectadas. Este é o primeiro relato que mostra a prevalência de NIV sobre DON em milho do Brasil.