PPARδ é um receptor nuclear que, quando ativado, regula o metabolismo de carboidratos e lipídios, e está relacionado com diversas enfermidades, tais como síndrome metabólica e diabetes tipo 2. Para entender as principais interações entre alguns ligantes bioativos e o receptor PPARδ, modelos de QSAR 2D e 3D foram obtidos e comparados com mapas de potencial eletrostático (MEP) e dos orbitais de fronteira (HOMO e LUMO), assim como resultados de docagem molecular. Os modelos de QSAR obtidos apresentaram bons resultados estatísticos e foram utilizados para predizer a atividade biológica de compostos do conjunto-teste (validação externa), e os valores preditos estão em concordância com os resultados experimentais. Além disso, todos mapas moleculares foram utilizados para avaliar as possíveis interações entre os ligantes e o receptor PPARδ. Portanto, os modelos de QSAR 2D e 3D, assim como os mapas de HOMO, LUMO e MEP, podem fornecer informações sobre as principais propriedades necessárias para o planejamento de novos ligantes do receptor PPARδ.