Hibridização genômica comparativa baseada em microarranjos
               em neonatos com anomalias congênitas: detecção de desequilíbrios cromossômicos

Dorfman, Luiza Emy; Leite, Júlio César L.; Giugliani, Roberto; Riegel, Mariluce

doi:10.1016/j.jped.2014.05.007

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Sumário

Artigos Originais • J. Pediatr. (Rio J.) 91 (1) • Jan-Feb 2015 • https://doi.org/10.1016/j.jped.2014.05.007 copiar

Hibridização genômica comparativa baseada em microarranjos em neonatos com anomalias congênitas: detecção de desequilíbrios cromossômicos^☆ ☆ Como citar este artigo: Dorfman LE, Leite JC, Giugliani R, Riegel M. Microarray-based comparative genomic hybridization analysis in neonates with congenital anomalies: detection of chromosomal imbalances. J Pediatr (Rio J). 2015;91:59-67.

Autoria SCIMAGO INSTITUTIONS RANKINGS

OBJETIVO:

Identificar desequilíbrios cromossômicos por meio da hibridização genômica comparativa baseada em microarranjos (CGH-array) em amostras de DNA de neonatos com anomalias congênitas de causa desconhecida de um programa de monitoramento de defeitos congênitos em uma maternidade pública.

MÉTODOS:

Uma análise genômica cega foi realizada retrospectivamente em 35 amostras armazenadas de DNA de neonatos nascidos entre julho de 2011 e dezembro de 2012. Todas as possíveis variações no número de cópias (CNVs) de DNA foram comparadas com as relatadas em bases de dados genômicos públicas, e sua relevância clínica foi avaliada.

RESULTADOS:

De um total de 35 amostras testadas, foram detectados 13 desequilíbrios genômicos em 12/35 casos (34,3%). Em 4/35 casos (11,4%), os desequilíbrios cromossômicos poderiam ser definidos como patogênicos; em 5/35 (14,3%) deles foram identificadas CNVs de DNA de relevância clínica incerta; e, em 4/35 (11,4%), foram detectadas variações normais. Dentre os quatro casos com resultados considerados relacionados causalmente aos achados clínicos, 2/4 (50%) apresentaram alterações causais já relacionadas a síndromes de microdeleção bem definidas. Em 2/4 amostras (50%), os desequilíbrios cromossômicos encontrados, embora preditivos como patogênicos, não estavam relacionados anteriormente a entidades clínicas reconhecidas.

CONCLUSÕES:

A análise de CGH-array permitiu maior taxa de detecção de anomalias cromossômicas, e essa determinação é valiosa principalmente em neonatos com anomalias congênitas de etiologia desconhecida ou em casos em que os resultados do cariótipo não podem ser obtidos. Além disso, embora a interpretação dos resultados deva ser refinada, esse método é uma ferramenta robusta e precisa que pode ser usada na investigação de primeira linha de anomalias congênitas e deve ser considerada em análises futuras/retrospectivas de amostras de DNA por programas de monitoramento de defeitos congênitos.

Defeitos congênitos; Anomalias congênitas; Triagem seletiva de recém-nascidos; Anomalias cromossômicas; Citogenética molecular; CGH-array

Caso n°	Principais características clínicas relacionadas
1^a	Sexo feminino, hérnia diafragmática congênita (HDC), microtia, hipertelorismo, cardiopatia congênita (CC) (dextroposição do coração), atresia anal
2	Sexo masculino, CC (Tetralogia de Fallot)
4	Sexo masculino, onfalocele, microcefalia
5	Sexo masculino, onfalocele, agenesia de membros, genitália ambígua, atresia anal, disfunção da bexiga
10	Sexo feminino, gastrosquise
12^a	Sexo masculino, HDC
13	Sexo masculino, focomelia unilateral, displasia da anca
14	Sexo masculino, assimetria craniana, fissura palatina (mole), hipertelorismo ocular, atresia esofágica tipo IIIB, camptodactilia do 3°, 4° e 5° dedos, clinodactilia do 5° dedo, pés tortos
15	Sexo masculino, atresia anal, pés tortos
16	Sexo feminino, atresia anal, genitália hipoplásica, CC
17	Sexo feminino, artrogripose múltipla congênita (amioplasia)
19	Sexo feminino, fissura labial unilateral (esquerdo) e fissura palatina não sindrômicas
22^a	Sexo feminino, microcefalia, hipoplasia cerebelar, oligoidrâmnio, hipoplasia pulmonar, displasia renal, hipoplasia genital, microgiria frontal, encefalocele occipital
23	Sexo feminino, onfalocele, microcefalia
24	Sexo masculino, micrognatismo, incisivo central superior único
25	Sexo feminino, fissura labiopalatina (bilateral) não sindrômica
29	Sexo masculino, CC (Tetralogia de Fallot)
30	Sexo masculino, fissura labiopalatina (bilateral) não sindrômica
31^a	Sexo masculino, artrogripose múltipla congênita (amioplasia), CC (Tetralogia de Fallot), displasia da anca
32^a	Sexo feminino, rim displásico multicístico bilateral, oligoidrâmnio
33	Sexo masculino, fissura palatina, pés tortos
34	Sexo masculino, fissura labial (esquerdo) e fissura palatina, bico de viúva, mamilos muito espaçados, hipoplasia genital, hipospadia
35	Sexo feminino, holoprosencefalia (HPE), oligoidrâmnio, microcefalia, atresia coanal unilateral
37	Sexo masculino, fissura labiopalatina (bilateral) não sindrômica
38	Sexo masculino, atresia esofágica tipo IIIB
40	Sexo masculino, retardo do crescimento intrauterino
41	Sexo feminino, gastrosquise
42	Sexo feminino, CC (Tetralogia de Fallot)
43	Sexo masculino, fissura palatina não sindrômica
44	Sexo masculino, microgiria, lisencefalia incompleta, micrognatismo
46	Sexo masculino, meningocele, pé torto (esquerdo)
47	Sexo feminino, gastrosquise
48^a	Sexo masculino, rim displásico multicístico bilateral, oligoidrâmnio, hipoplasia pulmonar bilateral
49	Sexo feminino, gastrosquise
50	Sexo masculino, artrogripose múltipla congênita, micrognatismo

Caso	Del/Dup	Localização das bandas dos cromossomos	Tamanho (Mb)	Coordenadas genômicas (hg 19)	Classificação	Principais características clínicas relacionadas
1^a	del	4p16.3-p15.33	12,90	71,552-12,976,346	Patogênico	Sexo feminino, HDC, microtia, hipertelorismo, CC (dextroposição do coração), atresia anal
14	del	17p13.3-p13.1	7,22	87,309-7,306,339	Patogênico	Sexo masculino, assimetria craniana, fissura palatina (mole), hipertelorismo ocular, atresia esofágica tipo IIIB, camptodactilia, clinodactilia do 5° dedo, pés tortos
16	del	8p11.2	0,13	39,258,894-39,386,158	Benigno	Sexo feminino, atresia anal, pés tortos
17	del	11p14.2-p14.1	0,22	27,006,061-27,225,374	VOUS	Sexo feminino, artrogripose distal, pés tortos
22^a	dup	9q31.3-q32	1,53	113,919,284-115,449,137	VOUS	Sexo feminino, microcefalia, hipoplasia cerebelar, oligoidrâmnio, hipoplasia pulmonar, displasia renal, hipoplasia genital, microgiria frontal, encefalocele occipital, hipoplasia cerebelar
25	dup	9p13.3-p13.2	1,89	36,163,040-38,050,778	VOUS	Sexo feminino, fissura labiopalatina (bilateral) não sindrômica
30	del	15q11.1-.q11.2	1,91	20,575,646-22,486,999	Benigno	Sexo masculino, fissura labiopalatina (bilateral) não sindrômica
31^a	del	1q44	1,52	247,695,693-249,212,668	VOUS	Sexo masculino, artrogripose múltipla congênita (amioplasia), CC (Tetralogia de Fallot), displasia da anca
	dup	6q22.31-q27	49,75	118,718,417-168,473,515	Patogênico
34	dup	22q11.23	0,23	25,664,618-25,892,253	Benigno	Sexo masculino, fissura labial (esquerdo) e fissura palatina, bico de viúva, mamilos muito espaçados, hipoplasia genital, hipospadia
37	dup	3q29	0.19	197,574,293-197,766,791	VOUS	Sexo masculino, fissura labiopalatina (bilateral) não sindrômica
38	dup	2p22.3	0.64	32,654,837-33,294,782	Benigno	Sexo masculino, atresia esofágica tipo IIIB
48^a	del	10q26.3	2.37	132,720,766-135,089,504	Patogênico	Sexo masculino, rim displásico multicístico bilateral, oligoidrâmnio, hipoplasia pulmonar bilateral

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[1] * Autor para correspondência.E-mail: mriegel@hcpa.ufrgs.br (M. Riegel).