Microlepidogaster longicolla, espécie nova, é descrita do rio São João da bacia superior do rio Paraná próximo a Brasília, no Brasil central. A espécie nova difere de M. perforatus, a única outra espécie do gênero, por ter linha lateral contínua, série média de placas laterais chegando até o final do pedúnculo caudal, menor espinho da nadadeira peitoral (13,4-16,2 vs. 18,2-21,0% do comprimento padrão), menor distância interorbital (38,9-43,1 vs. 47,7-53,3% do comprimento da cabeça), e mais dentes no dentário (16-29 vs. 12-15), além de várias características osteológicas. Microlepidogaster longicolla possui um marcado dimorfismo sexual secundário, envolvendo a presença de papila urogenital cônica em machos, a presença de uma aba carnosa ao longo da margem dorsal do primeiro raio engrossado da nadadeira pélvica em machos, a nadadeira pélvica mais longa dos machos e o primeiro raio da nadadeira pélvica mais fortemente curvado nas fêmeas.
