Gymnotocinclus anosteos, novo gênero e espécie, é descrito de um córrego de cabeceira da bacia do alto rio Tocantins no Brasil central. O novo táxon é distinto de outros loricarídeos pela extrema redução das placas dérmicas, apresentando o corpo quase completamente sem placas. Três outras características diagnósticas são: a ausência do osso lateral, ausência de espinhos hemais bífidos e a presença de odontódeos na última série de placas dérmicas do pedúnculo caudal dorsalmente ou anteriormente curvados. Estas características derivadas não são compartilhadas com nenhum outro gênero de Hypoptopomatinae e o novo taxon é hipotetizado como membro basal da subfamília. Os estados de caracteres propostos por filogenias anteriores da subfamília são examinados e suas relações são discutidas.