Genes da Glutationaperoxidase em batatas-doces ancestrais: caracterização do genoma e análise bioinformática

RESUMO

As glutationas peroxidases vegetais (GPXs) consistem em peroxidases não-heme tiol vitais na manutenção da homeostase do peróxido de hidrogênio e na regulação das respostas ao estresse ambiental das plantas. Foi efetuada uma análise genômica comparativa da família de genes GPX em Ipomoea trifida e I. triloba, utilizando-se seus respectivos genomas. Foram identificados 6 genes GPX em cada espécie, que estavam localizados de forma desigual em 4 dos 15 cromossomos dos ancestrais mais próximos dos genomas da batata-doce (I. trifida e I. triloba). Apresença de duplicações gênicas e a seleção positiva foram destacadas, sugerindo o significado evolutivo dos genes GPX nessas espécies. Com base na análise filogenética, os genes GPX de I. trifida, I. triloba, Arabidopsis thaliana e Oryza sativa podem ser classificados em quatro grupos (I, II, III e IV). A análise da expressão in silico em diferentes tecidos e estágios de desenvolvimento mostraram padrões de expressão específicos de tecidos, sugerindo papéis especializados para os genes GPX em diferentes órgãos vegetais. No entanto, os genes ItfGPX5 e ItbGPX5 foram altamente expressos na maioria dos tecidos estudados.

PALAVRAS-CHAVE:
Genômica comparativa; espécies de Ipomoea; expressão gênica; classificação filogenética