Workflows/ Repositórios
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Galaxy |
Estratégias de análise e ferramentas para práticas de rastreamento, troca de informações entre usuários, laboratórios e plataformas |
Online/Livre |
175 |
Taverna |
Desenvolvido para combinar e distribuir serviços Web ou ferramentas locais em estratégias de análises complexas |
Online/Livre |
176 |
KNIME |
Análises de grandes conjuntos de dados e visualizações de alta qualidade |
Online/Livre |
177 |
MetaboLights |
Base de dados para experimentos em metabolômica e informações relacionadas |
Online/Livre |
178 |
Metabolomics Workbench |
Repositório público para meta-dados, dados experimentais, padrões metabólicos, protocolos, tutoriais e treinamento |
Online/Livre |
179 |
Ferramentas e Base de Dados para EM (CLAE e CG)
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XCMS |
Alinhamento de tempos de retenção; filtração comparada; detecção de picos; comparação espectral e identificação molecular |
Online/Livre |
137, 165 |
MzMine 2 |
Software adequado para o processamento de dados aplicados a análise de metabolômica alvo e não alvo |
Software/Livre |
135, 165 |
7-Golden Rules |
Pacote para predição de moleculares a partir de peso molecular padrões isotópicos |
Software/Livre |
180 |
BinBase |
Base de dados voltada para identificação estrutural |
Online/Livre |
181 |
Global Natural Products Network (GNPS) |
Plataforma para análise e visualização de dados usando redes moleculares aplicados aos produtos naturais e peptídeos |
Online/Livre |
143 |
LipidBank |
Base de dados em tecnologia orbitrap para análise de lipídeos |
Online/Livre |
182 |
MMD database |
Dados de CLAE e CG-EM de pequenas moléculas |
Online/Livre |
183 |
Mass Bank |
Fornece MS e MS/MS de compostos orgânicos para ciências da vida (<3000 Da) |
Online/Livre |
184 |
MetFrag |
Plataforma online para identificação de moléculas a partir de espectros de massas (CLAE-EM) e ferramentas in silico
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Online/Livre |
185 |
METLIN |
Plataforma para identificação de metabólitos conhecidos e desconhecidos e outras entidades químicas (CLAE-EM e EM/EM) |
Online/Livre |
131 |
MzCloud |
Plataforma que disponibiliza dados de ESI-EM, APCI-EM e EM/EM de compostos orgânicos e inorgânicos |
Online/Livre |
48 |
AMDIS |
Software utilizado para processamento de dados de CG-EM em conjunto com bases de dados como NIST |
Software/Livre |
132 |
FiehnLib |
Base de dados de CG-EM com dados de índice de retenção de mais de 1000 metabólitos |
Comercial |
130 |
Golm Metabolome (GMD) |
Plataforma com espectros de CG-EM de metabólitos de plantas e animais |
Online/Livre |
186 |
NIST MS e retention Index Database |
Maior base de dados de espectros de IE-EM em valores de índice de retenção de compostos |
Banco de dados comercial |
48 |
Ferramentas e Bases de Dados para RMN
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Bruker Topspin |
Software no qual fornece fácil acesso a bibliotecas de sequencias de pulso assim como executa ações em instrumentos e permite o processamento de dados |
Software/Comercial |
175 |
MestreNova |
Software multidisciplinar adequado para análise e processamento de dados de RMN combinados a CLAE-EM e CG-EM |
Software/Comercial |
187 |
NMRlab/MetaboLab |
Software de uso geral para tratamentos de dados de RMN (baseado em ambiente MATLAB) |
Software/Livre |
188 |
rNMR |
Software de código aberto para análise de dados de RMN |
Software/Livre |
189 |
ACD labs Aldrich NMR library |
Biblioteca de espectros de 13C e 1H RMN de compostos (>200.000) |
Software/Comercial |
48 |
BioMagResBank - BMRB |
Espectros de 1H e 13C RMN de metabólitos de plantas e animais |
Online/ Livre |
190 |
Bruker AMIX |
Espectros 1D e 2D NMR de metabólitos a múltiplos valores de pH |
Software/Comercial |
48 |
Chenomx Inc. |
Software para processamento e análise de dados de RMN e conta com biblioteca de dados |
Software/Comercial |
191 |
MetaboMiner |
Ferramenta metabolômica para o processamento de pico e rápida identificação metabólica por meio de espectros de TOCSY e HSQC |
Online/Livre |
192 |
NAPROC-13 |
Base de dados de espectros de 13C RMN de >6000 produtos naturais |
Online/Livre |
193 |
NMRShiftDB |
Base de dados com espectros de NMR de produtos naturais e compostos orgânicos |
Online/Livre |
194 |
Outras Bases de Dados
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ChemBank |
Base de dados de pequenas moléculas com informações associadas à ensaios biológicos |
Online/Livre |
195 |
Chemical Entities of Biological interest (ChEBI) |
Base de dados e ontologia molecular focada em pequenas moléculas |
Online/Livre |
196 |
NuBBEDB |
Base de dados moleculares e espectrais dos produtos naturais da biodiversidade Brasileira |
Online/Livre |
197 |
PubChem |
Base de dados de moléculas com bioensaios e atividades biológicas descritas |
Online/Livre |
198 |