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Evaluation of SSR and SNP markers in Rubus glaucus Benth progenitors selection

Avaliação dos marcadores SSR e SNP na seleção de progenitores em Rubus glaucus Benth

Resumo

Amora de castilla (Rubus glaucus Benth) é um dos produtos com maior potencial de desenvolvimento agrícola Colômbiano, que combina características dos subgéneros Idaeobatus e Rubus. Apesar da sua reconhecida importância na geração de rendas para os pequenos produtores, este cultivo tem recebido pouco desenvolvimento tecnológico. Como resultado a semeadura desta espécie é feita mediante cultivares locais propagados asexualmente pelos agricultores. Os produtores associados de amora na Colômbia têm ressaltado a necessidade de formalizar a oferta de cultivares para semente, começando com processos de fito-melhoramento para obter variedades mais produtivas, com características morfológicas que ajudem nas atividades culturais. O presente artigo, mostra os resultados da avaliação com marcadores tipo SSR e SNP obtidos em trabalhos prévios desde uma análise do transcriptoma por ARN-Seq. Quinze cultivares promissórios de R. glaucus foram avaliados para ser possivelmente utilizados num futuro processo de cruzamento. Na caracterização, 22 marcadores tipo SSR e 78 marcadores polimórficos tipo SNP foram selecionados. Dos 22 marcadores SSR usados, 15 rendeu amplificação positiva gerando um total de 29 loci e 58 alelos. Similarmente, dos 78 marcadores tipo SNP avaliados, 36 mostraram amplificação positiva. As sequencias obtidas dos produtos amplificados com SNP mostraram uma alta homologia com espécies da família Rosaceae. Os critérios de seleção dos progenitores foram realizados com base em os resultados das caracterizações moleculares junto com os critérios morfológicos úteis no manejo do cultivo. Este trabalho prova a utilidade dos marcadores moleculares para estimar a diversidade genética dos possíveis progenitores para ser usados num processo de fito-melhoramento. Um aspecto conhecido como o desenvolvimento da população parental, e que determina de uma forma grande o sucesso dos processos de fito-melhoramento.

Termos para indexação
Fito-melhoramento; amora de castilla; diversidade genética

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