O intestino de cada animal é o nicho de um ecossistema complexo e dinâmico com efeitos importantes para o hospedeiro. As comunidades microbianas componentes deste ecossistema e/ou os produtos finais do metabolismo influenciam a digestão e absorção de nutrientes, o metabolismo das mucosas, a fisiologia geral e as respostas imunitárias locais e gerais da ave hospedeira. A melhor compreensão do ecossistema microbiano do intestino das aves pode levar a melhorias na produtividade, saúde, bem estar, e redução de agente patogênicos dos alimentos e do impacto ambiental da produção avícola para uma indústria mais sustentável. Os métodos moleculares da ecologia microbiana são ferramentas chaves para obter este conhecimento. O objetivo desta apresentação é descrever os conceitos básicos, aplicações, vantagens, limitações, e evolução destes métodos moleculares usados para estudar a ecologia microbiana do intestino. A meta final é estimular sua aplicação em pesquisa avícola aplicada e desenvolvimento de novos aditivos para alimentos. Alguns exemplos práticos em pesquisa avícola serão descritos para ilustrar sua relevância para avançar em métodos de controle de agentes patogênicos, evitar ou manejar a disbiose ou doenças intestinais sub-clínicas, reduzir o impacto ambiental, esclarecer os efeitos dos nutrientes na mucosa intestinal, a microflora e, em geral, melhorar o desempenho das aves.
ecologia microbiana do intestino; métodos moleculares; nutrição
