O presente estudo investigou se mutantes do vírus da hepatite B (HBV) circulam na região Sudoeste do Estado do Paraná, Brasil, analisando amostras de crianças que receberam a imunoprofilaxia por terem nascido de mães portadoras do HBV. Amostras de 25 crianças foram analisadas para os marcadores sorológicos do HBV e para o DNA-HBV por PCR. Somente uma amostra foi positiva para AgHBs, anti-HBs e DNA-HBV, apesar da criança ter sido vacinada. Análises da seqüência do gene S desta amostra mostrou a presença de uma prolina na posição 105, uma serina na posição 114, três treoninas nas posições 115, 116 e 140, e uma glutamina na posição 129. A presença destes aminoácidos, exceto para Serina na posição 114, tem sido relacionada a terapia monoclonal ou policlonal com anti-HBs após transplante de fígado, enquanto a presença da treonina na posição 116 tem sido descrita em crianças imunizadas de Singapura. Este achado demonstra a possível circulação de cepas do HBV resistentes a imunoprofilaxia para hepatite B no Sudoeste do Paraná, Brasil. O genótipo da amostra foi identificado como genótipo D, o qual é frequentemente encontrado na região estudada. Desde que 36% das crianças tinham recebido incompleta ou nenhuma imunoprofilaxia, um seguimento mais intensivo das crianças nascidas de mães AgHBs positivo é necessário.