Doze cepas de Trypanosoma cruzi isoladas de reservatórios silvestres, triatomíneos e de pacientes chagásicos crônicos do Estado do Paraná, Brasil, classificadas como Tc I e II foram usadas para avaliar a correlação entre genética e diversidade biológica. Índice fagocítico (IF) e produção de óxido nítrico (ON) in vitro foram os parâmetros biológicos utilizados. O IF de cepas T. cruzi I e II não diferiram significativamente assim como o IF de cepas isoladas de humanos, triatomíneos ou de reservatórios silvestres. Há diferença estatística na inibição da produção de ON entre T. cruzi I e II e entre parasitos isolados de humanos e de cepas isoladas de triatomíneos e reservatórios silvestres, mas não foi observada correlação entre genética e biologia quando as cepas foram analisadas independentemente da linhagem ou hospedeiros das quais elas foram isoladas. Observou-se correlação significativa para amplificação aleatória do DNA polimórfico e parâmetros biológicos de Tc I ou II e para os seres humanos ou reservatório silvestre quando linhagens ou hospedeiros são consideradas separadamente.